Ο Γιάννης Αρναούτης είναι ειδικός στον τομέα της υδάτωσης, με πολυάριθμες δημοσιεύσεις σε Διεθνή περιοδικά. Το γνωστικό του αντικείμενο αφορά την αθλητική διατροφή και πώς επηρεάζει την απόδοση ασκούμενων αλλά και αθλητών. Πιο συγκεκριμένα η έρευνά του εστιάζει: στην επίδραση των εργογόνων συμπληρωμάτων στην απόδοση αθλητών, καθώς και στην επίδραση των επιπέδων υδάτωσης στην αθλητική απόδοση και σε δείκτες υγείας.